直肠炎的发生可以与衣原体感染有关。人体感染衣原体后，可以患有衣原体性的直肠炎，但是在临床上非常少见。
衣原体是一种常见的病原微生物，体积大于病毒，而小于细菌，可以分为多种类型，其中沙眼衣原体，可以引起性传播疾病，以及盆腔炎、直肠炎等。衣原体的传播可以分为直接传播和间接传播。
因此，当接触衣原体患者或者接触沾有衣原体的物品时，都有可能会感染衣原体。因此当直肠粘膜有机会接触到衣原体时，便有可能会引起衣原体性的肠炎，可以引起大便次数增多、排便不尽感、腹泻以及下腹部疼痛等临床症状。