尿毒症是慢性肾衰竭的终末期，药物治疗往往起不到多大效果，只有通过肾脏替代的治疗方法，才能缓解尿毒症的症状，即血液透析、腹膜透析和肾移植手术，选择哪种替代治疗要根据患者的具体病情而定。
但是有下列情况应首选腹膜透析：一、严重心脏病或冠状动脉病变，不能耐受血液透析者；二、无法建立血管通路者；三、有严重出血倾向，尤其是伴有眼底出血者。若患者有腹部大手术、广泛肠粘连、晚期妊娠、腹腔巨大肿瘤及多囊肾应选择血液透析治疗。
腹膜透析对残余肾功能的保护优于血液透析，当患者仍有残余肾功能时，应首选腹膜透析，在适情选择继续腹膜透析或改为血液透析，这样既能达到早期透析的目的，又能保证透析的充分性。
肾移植是最好的替代治疗，但由于肾源短缺，往往得不到普及。