尖锐湿疣之所以会复发，是由于局部病毒没有清除干净而引起。
尖锐湿疣会在生殖器等部位生长疣体，在选择使用物理治疗手段将疣体去除干净之后，在局部的皮肤或黏膜表面，会残留人类乳头瘤病毒。如果免疫力较弱，没有及时使用抗病毒类的外用药膏进行治疗，残留的病毒会不停分解、复制，就有可能会导致皮肤和黏膜表面生长新的疣体。
所以，在治疗尖锐湿疣之后，要在患处涂抹重组人干扰素凝胶，或者是抗HPV生物蛋白敷料等药物，降低疾病的复发概率。