部分肛门疣需要动手术切除。对于一些疣体比较大以及多发性的疣体，需要采取手术切除来治疗。手术切除以后，再配合其他综合治疗，防止其术后出现复发。手术中一般采取电刀切除，可以在切除疣体的同时，烧灼根部创面，防止出血。
而对于一些单发的或者比较小的，患者可以采取激光、电灼或者冷冻的治疗方法去除疣体，并且配合光动力治疗，消除一些隐性的病变，防止复发。另外，还包括药物治疗。
所以，要根据不同的类型，以及严重程度采取不同的治疗方法，达到最佳的治疗效果。