颅内的畸胎瘤多数情况下不会引起腹痛的临床表现，是因为颅内畸胎瘤包括了良性的和恶性的两大类。对于良性的颅内畸胎瘤，临床上主要是以颅内的症状为主。而对于恶性的颅内畸胎瘤，多数情况下也是以颅内的播散为主，很少发生颅外的侵犯。
临床上患者的主要症状主要是颅内压增高引起的头痛、呕吐、视神经乳头水肿等表现。还有的患者会出现视力的障碍、听力的下降，甚至是耳聋的。还有的患者会出现小脑共济的失调、颅神经损伤或者是颅神经麻痹的临床症状。
有少数患者可以出现癫痫发作等，还有的患者会出现肢体运动的障碍、感觉的异常等临床表现，颅内畸胎瘤主要是以颅内的症状为主。