良性乳腺肿瘤同样是需要进行手术切除的。而手术切除的手段，也是治疗良性乳腺肿瘤唯一有效的治疗办法。
比如临床上常见的乳腺纤维腺瘤和乳管内乳头状瘤，都是以手术切除为主。其中，乳房纤维腺瘤虽然是良性的肿瘤，癌变可能性比较小，但是有肉瘤变的可能，所以手术切除可以将乳房纤维腺瘤完全切除，避免了发生癌变或者肉瘤变的机会。
同样，乳管内乳头状瘤也需要进行手术的切除，将病变完全切除之后送病理学检查。如果有恶变存在，应该进行乳腺癌的根治性手术。