肾结石的临床症状多种多样，其中最常见的症状有腰部疼痛以及肉眼血尿，部分患者排出结石时可有较为剧烈的绞痛。
如果结石并发梗阻和感染可以出现发热、无尿、肾积水，严重的双侧梗阻性结石可以出现肾功能不全。许多肾结石患者平时没有任何临床症状，仅在查体时发现有肾结石，肾结石引起肾绞痛时，患者查体可以有肾区的叩击痛，没有肌紧张。
如果节食导致严重的肾积水时，查体可发现肾脏局部包块。肾结石一旦发现，应该尽早的治疗，以免肾结石的增大。