肛瘘脓肿破了不怎么疼，还要做手术的。这只是病程中的一个阶段，只有做手术才能彻底痊愈。
肛瘘初期的临床表现是脓肿的体征，通过外口排出脓液。脓液的多少，因瘘管的长短和大小不同而不同。新生成的瘘管流脓较多，在排出脓液后外口可以封闭。患者一般无明显症状，此后反复随着内口进入粪便，引起感染，窦腔内压力增高，排出不通畅，再次引起外口排脓，周而复始。
所以尽管脓液排出，疼痛减轻或者消失，其实其原发病灶并未去除，持续存在，反复引起感染，所以建议手术。