绒毛膜癌可以导致全身多个部位的转移，临床上转移几率最高的部位就是肺。绒毛膜癌转移到肺部后可以在肺内快速的生长，患者会出现胸痛的症状，有些患者可以表现为咳血。
绒毛膜癌转移到肺脏主要以血液循环转移为主，癌细胞还可以通过直接蔓延转移到阴道，可以导致阴道内出现实性的肿块，肿块可以发生破裂大出血。
绒毛膜癌还可以通过血液循环转移到大脑内，导致患者发生颅内占位性的病变，脑转移是导致患者发生死亡的主要原因。此外还可以发生肝脏、脾和泌尿系统的转移。