对于卵巢巧克力囊肿特别大的女性，可能会压迫到膀胱，引起尿频、尿急表现，但对于卵巢巧克力囊肿比较小的患者，一般不会引起明显的压迫症状。
在没有月经来潮期间，这类女性没有任何的不适症状，一般都可以通过药物来进行保守治疗，以抑制卵巢巧克力囊肿的持续长大。
但对于巧克力囊肿特别大的女性，不但会压迫到膀胱，还会引起明显的腹胀，甚至会出现巧克力囊肿破裂或者扭转现象，通常都需要进行手术切除治疗。在手术以后还要配合药物治疗，避免卵巢巧克力囊肿出现复发。