肛瘘手术后切口一直都不愈合，可能是术中未准确找到内口，内口依然存在，而且反复感染，会有脓液自切口处流出，导致切口在慢性炎症的刺激下一直不愈合。
这时可将亚甲蓝注射液经切口处逆向注入，观察肛内是否有亚甲蓝染色，来明确内口是否愈合。
如果肛内出现亚甲蓝染色，说明内口确实没有愈合，这时应进行二次手术，对肛瘘进行根治。
如果肛内未出现亚甲蓝染色，说明内口已经愈合，针对切口长时间不愈合的情况，可采用外抹湿润烧伤膏等刺激肉芽生长的药膏，或涂抹重组人表皮生长因子，以促进上皮组织的生长。经上述治疗，相信肛瘘切口很快就会愈合了。