大多数的手足口病通常是隔离1~2周左右，尤其是在发病后的第1周，传染性较强，一定要进行严格隔离，防止出现传染。也有部分比较严重的手足口病，有可能隔离时间会相应延长，要根据患儿的恢复情况而定，只有在完全康复的情况下才能够解除隔离。
在隔离期间也要做好各方面的护理，多休息，清淡饮食，注意口腔以及局部的皮肤卫生，可以在医生的指导下使用非处方类药物改善疼痛发热等症状。
在完全康复以后，也不要与其他手足口病患儿密切接触，防止再次感染。