阴茎癌的确切病因至今仍不清楚，大家公认的是与包茎和包皮过长关系密切，包皮垢以及慢性炎症刺激是阴茎癌的重要病因。
大量的研究结果显示，婴幼儿期行包皮环切术可以预防阴茎癌的发生，而儿童期或成年以后再行包皮环切术并不能降低阴茎癌的发病率。
因此，患有包茎的患者应尽早手术治疗。而对于包皮过长的人来说，保持包皮局部的清洁最为重要，也可以降低阴茎癌的发病率。
现在临床上所见阴茎癌患者中绝大多数都有包茎。此外，阴茎癌相关病因还包括患有阴茎硬化性苔藓、疣、湿疣、人乳头状瘤病毒感染以及包皮环切不彻底，因此，有上述疾患的患者理应尽早治疗。