胃切除手术后的后遗症主要有以下几方面：
1.碱性反流性食管炎。因胃体大部分被切除后会导致胃酸分泌不足，而且胃切除后胃的蠕动受影响，会导致胆汁或肠液反流，胆汁、肠液为碱性，会引起食道炎出现。
2.胃恶性肿瘤患病率提高。这是因为胃大部分切除后，导致胃酸分泌减少，胃内环境发生了变化，导致菌群失调。引起胃内亚硝酸盐增多，残胃出现癌变的几率明显提高。
3.胃瘫。在切胃过程中，切断了迷走神经主干导致胃蠕动差，出现胃瘫的后遗症。