肺泡蛋白沉积症的患者如果病情比较轻，大多不会出现明显呕吐症状。这种疾病主要是以进行性气促加重为主要特点，尤其在患者活动后会出现明显的病情发作，可以出现咳嗽、咳痰等症状，痰液大多为白色黏稠状。
如果患者出现肺感染并发症时，可以出现胸痛、咳嗽、咳粘痰、痰中带血等症状。如果病变引起呼吸衰竭的并发症时，会出现呼吸困难逐渐加重，严重缺氧的表现。有严重细菌感染的患者可以使用哌拉西林、莫西沙星等抗生素类药物治疗，根据病情进行雾吸入，全肺灌洗等，这样有利于病情的控制。