部分脑梗塞可以手术治疗，但是大部分的脑梗塞不需要手术，临床上还是以药物治疗为主。
现在对于急性脑梗塞的治疗，尤其是中重度的急性脑梗塞，主张在3小时以内给予静脉溶栓治疗，然后就立刻桥接血管内介入治疗。血管内的介入治疗就是一种微创的手术治疗，它通过动脉穿刺把导管、支架等送到血栓形成、闭塞的颅内动脉，直接把堵塞脑动脉的血栓抽吸掉，或者在血栓堵塞、狭窄的动脉处置入支架，起到再开通堵塞的脑动脉的作用。
还有一种手术治疗是开颅手术，这是针对大面积的脑梗死，脑组织坏死的面积大引起了脑疝的患者，通过开颅减压，可以为进一步的治疗创造机会，挽救生命。