新生儿低血糖的后遗症可以造成孩子明显地出现脑损伤，通常血糖值越低出现的时间越早、持续的时间越长，造成的脑损伤也越严重。
一般低血糖脑损伤发生在孩子生后的第六天，低血糖发生以后会造成的脑损伤，可以造成孩子出现明显的脑瘫、智力低下、肌张力低下，走路不稳，肌肉萎缩，所以对于新生儿的低血糖要积极进行干预治疗。
新生儿低血糖多见于早产、双胎、低出生体重儿或糖尿病母亲生产的婴儿，对这些高危的新生儿要积极地进行监测血糖，给予必要的治疗，有时候要输注静脉的葡萄糖，以防止低血糖后遗症的发生。因为低血糖对于孩子的损伤是比较严重的，所以要及时地监测，防止低血糖后遗症脑损伤的发生。