感染幽门螺杆菌有可能会引起肠胃炎。假如患者也感染巨细胞病毒或者轮状病毒、大肠杆菌以及葡萄球菌等病原微生物时，也可能会导致患者出现急性肠胃炎的临床表现。
临床当中引起肠胃炎比较常见的原因是感染因素，在选择用药方面可能需要先明确具体的感染病原微生物类型后，再使用抗感染药物，对于疾病的恢复有很大的帮助。
如果病原微生物种类不是很明确，就给患者使用各种抗生素治疗时，反而会加重患者的肠胃炎症状，导致患者症状的加重。