扁平疣突然发红发痒，并且鼓起来，原因有很多。比如皮肤的过敏症状，会出现扁平疣的疣体变红肿胀，并且伴随瘙痒的症状。如果是这种情况，可以涂抹炉甘石洗剂，服用氯雷他定口服液维生素c片进行抗过敏治疗。
另外，扁平疣本身也是属于一种自限性的疾病，如果病程已经超过了一年半到两年，突然出现扁平疣，发红鼓起来，也有可能是属于扁平疣自行恢复、疣体脱落的一种表现。其次，也有可能是属于扁平疣疾病的一种急性进展期会出现这一种症状，并且疣体数量会迅速地增加。
如果出现这种情况，应该积极地采取免疫调节剂以及抗病毒的治疗措施。另外，突然发红发痒鼓起来，也有可能是继发性感染，要及时地抗感染治疗。