轻微感冒打疫苗的危害主要是影响疫苗的效果，可以出现明显发烧或其他不适。
由于患者本身的感冒多是由病毒感染引起的，如果这时注射疫苗可能会影响疫苗的效果。由于患有感冒，身体抵抗力较差，在这期间接种疫苗，身体会由于接种疫苗导致免疫系统开始产生抗体，从而对抗病毒，会出现发热的情况。这时打疫苗往往会导致高热，可能会引起严重的后果。另外，还有部分患者会出现感冒病情加重，也有部分人出现局部疼痛，身体不适的感觉，儿童还可以哭闹、厌食等。
因此，如果轻微感冒，最好暂时不打疫苗，等感冒彻底好了之后再去打疫苗。