盆腔CT最重要查膀胱、女性查子宫，男性查前列腺、直肠等脏器，最常见疾病有盆腔积液、前列腺增生、前列腺癌、膀胱占位、输尿管下端结石等。
现在由于彩超可以做阴式彩超，所以女性子宫以及附件彩超可以排除大部分疾病，如子宫肌瘤、宫颈癌等疾病。男性前列腺外科触诊以及彩超也能排除大部分前列腺疾病、前列腺炎、前列腺增生等疾病。膀胱痛过膀胱镜直观观察也可以排除大量疾病，例如膀胱癌。直肠空腔脏器本身诊断困难，又有肠镜，基本也不用盆腔CT来诊断。最重要诊断上述检查看不见的内部结构，如积液情况、淋巴结情况等。
还有一些往盆腔转移的疾病，盆腔CT一目了然。