甲状腺癌微创手术的缺点是，在进行切除甲状腺时，由于空间较小，无法使喉返神经完全暴露，可能会对喉返神经造成损伤，落下一些后遗症。
由于在微创手术时，视野较窄，无法完全显露，在进行甲状腺血管结扎时不彻底，可能会在术中或术后出现大出血。但是甲状腺癌微创手术也具有一定的优势，能够减少手术疤痕。
在患有甲状腺癌疾病以后，应当进行全面地检查，评估病情的严重程度，然后听从医生的指导意见，选用适合于患者的手术方法进行治疗。在术后也需要做好各方面护理，防止复发。