小儿贫血不一定都要做骨髓穿刺，小儿的骨髓穿刺绝大部分是应用在一些血液肿瘤、再生障碍性贫血这一类的疾病。
白血病是由于骨髓的白细胞系统异常的增生，抑制了红细胞系统的增生而导致出现贫血。但同时它也有一些肿瘤细胞浸润的表现，它出现的贫血是由于肿瘤细胞所导致的。
骨髓穿刺的目的一个是有助于白血病的定型，因为白血病可以分为急粒、急淋、急单等。它们虽然有贫血，但是种类不太一样，所以，骨髓穿刺有利于治疗。
再生障碍性贫血由于骨髓细胞的红系统造血能力严重不足所导致，所以，骨髓穿刺应用在这些疾病是有助于诊断，也有助于治疗。一些血小板减少性的紫癜也会出现骨髓的增生不足，所以，骨髓穿刺在儿童是有助于这些疾病的诊断。