蛛网膜囊肿是否危险与囊肿的大小有关。
因为蛛网膜囊肿在增大以后，可能会压迫到脑内的其他组织，从而引起癫痫发作、脑积水、剧烈的头痛。如果压迫到了脊髓，还容易使患者出现轻度的瘫痪或者是全瘫，会严重影响到患者的生活质量。此外，蛛网膜囊肿还有可能会出现自发性的破裂或者出血，在严重时可能会危及到患者的生命，因此，蛛网膜囊肿是比较严重的。
如果蛛网膜囊肿较小，通常先不予治疗，应临床观察。如果囊肿较大，引起了明显的症状，主要是以手术切除为主，比如开颅囊肿切除术、囊肿腹腔分流手术等。