如果是正常生长发育当中发生变异引起的矮小症，一般不会造成其它系统发育不良。
如果是心理因素、生长激素缺乏、营养不良、性早熟、遗传代谢性疾病或者其它慢性疾病引起的，很有可能会造成其它系统发育不良，比如骨骼系统等，孩子会表现为身材矮小、发育迟缓、代谢异常等，还有心理的自闭、孤僻、自卑，还会严重影响到社交能力等。
治疗主要有营养、运动和心理治疗，以及根据孩子所缺乏的激素给予相应的替代治疗，比如生长激素、促生长激素释放激素等。