抠肚脐眼发生肚子疼痛，可能是由于肚脐眼局部的皮肤比较薄弱，经常抠肚脐导致表面的保护黏膜被破坏，经常刺激肚脐眼局部的神经，引起反射性疼痛。
如果局部的皮肤发生糜烂，还容易导致细菌入侵，引起炎症感染，也可导致肚子疼痛的现象。要用碘伏局部消毒之后，应用消炎的药膏涂抹在表面进行消炎，能逐渐改善疼痛的症状。
如果本身由急性胃肠炎所引起肚子疼痛，一般疼痛比较剧烈，甚至会伴有腹泻或者发烧等相关的临床症状，需要进一步到医院确诊之后给予止泻药物进行对症治疗。