糜烂性胃炎的病因包括幽门螺菌感染引起。健康志愿者在吞服幽门螺杆菌后的临床表现、内镜所见及胃粘膜活检病理组织学均显示有急性胃炎的特征，但临床上很难诊断幽门螺杆菌感染引起的糜烂性胃炎，因为一过性的上腹部症状多不为患者注意，也极少需要胃镜检查。另外可能多数患者症状很轻或没有症状。
除幽门螺杆菌之外的病原体感染及其毒素对胃黏膜损害引起的糜烂性胃炎，进食被微生物或其毒素污染的不洁食物所引起的糜烂性胃炎以肠道炎症为主。由于胃酸的强力抑菌作用，除幽门螺杆菌之外的细菌很难在胃内存活而感染胃黏膜，一般人很少患除幽门螺杆菌之外的感染糜烂性胃炎，但当机体免疫力下降时，可发生各种细菌、真菌、病毒所引起的糜烂性胃炎。
另外其他病因如饮酒、刺激性食物、暴饮暴食等也可以引起胃黏膜多发性糜烂为特征的糜烂性胃炎，常伴有胃粘膜出血，可伴有一过性的浅溃疡形成。