便秘灌肠没有什么副作用。便秘患者是大便滞留在肠道，时间长干结，通过灌肠可以促进肠道蠕动，让大便及时排出来。
偶尔的灌肠一次对身体没有伤害，如果经常灌肠，就有可能会出现依赖性。建议便秘患者主要是饮食控制，多吃蔬菜和水果，长期的绿色蔬菜主要是白菜、西兰花、菠菜、芹菜、韭菜，这些粗纤维食物可以促进肠道蠕动，排出宿便。
习惯性便秘，需要经常按摩肚脐周围，餐后尽可能的运动30分钟，可以改善肠道功能，饮食上不能够吃太油腻和辛辣食物，也不要吃生冷、寒凉食物。