正常的阴道内有微生物寄居，形成阴道正常的微生物群，包括革兰氏阳性需氧菌及厌氧菌、乳杆菌、肠球菌以及革兰氏阴性需氧菌、加德纳菌、厌氧菌、支原体及假丝酵母菌等。正常阴道的微生物群中，以产生过氧化氢的乳杆菌为优势菌。乳杆菌除维持阴道的酸性环境外，其产生的过氧化氢，细菌素等抗微生物因子可以抑制微生物的生长。同时通过竞争排斥机制阻止致病微生物粘附于阴道上皮细胞，维持阴道的微生态平衡。阴道生态平衡一旦被打破也能导致炎症的发生。