打哈欠的时候耳朵疼痛，多见于下列几种疾病的症状：
1.咽喉炎或扁桃体炎，扁桃体或咽喉发炎后，咽喉部位的黏膜本身会出现充血、肿胀的情况。打哈欠的时候，张嘴的动作会牵拉到肿胀的黏膜引发疼痛。而咽喉距离耳后部比较近，疼痛就会放射到耳部附近。
2.腮腺炎，患有腮腺炎的患者，整个脸部、脸颊部位都会有疼痛感，而打哈欠会导致发炎的脸颊部位，连带耳部疼痛。
3.耳道炎或外耳炎，耳朵内本身的炎症感染，也会导致在打哈欠或是咀嚼的时候，引发刺激性的疼痛感出现。