导致女性小便尿道刺痛的原因不同，处理方式也不一样。
如果是由于女性尿道损伤所引起的尿道刺痛，比如在性生活时用力过大，会对尿道造成过度挤压，使尿道局部破溃出血，排尿时尿液会刺激损伤部位，就可引起尿道疼痛，一般还伴有轻度的血尿。通常不需要进行特殊治疗，应多休息、禁止性生活，通常在5~7天会自愈。
如果女性小便尿道刺痛，为泌尿系统感染疾病所引起，在确诊后主要是使用左氧氟沙星、头孢地尼等抗感染药物予以治疗，并且要多饮水、多排尿。