空孕囊本身并不会对下次怀孕造成明显影响，但是造成空孕囊的原因，有可能会影响下次的怀孕。
因为在临床上导致孕妇出现空孕囊的原因，主要是与夫妻伴侣身体的染色体异常、免疫系统的异常、内分泌系统的异常或者是怀孕期间受到的感染性因素有关系，与男性的精子质量和女性的卵子质量也有关系。
如果夫妻伴侣确实存在上述异常，导致怀孕出现了空孕囊的情况，而上述疾病没有经过规范化的治疗，病情没有得到控制或逆转，再次怀孕后还有可能出现空孕囊。