小便刺痛可能会自愈。轻微的尿路感染或者是尿道损伤而发生的刺痛不适感觉，在个体自身免疫作用下，不需要药物治疗也可能会自愈。
但是感染或者是损伤较重而伴随的较重刺痛不适感觉，则需要辅助尿液常规化验检查，给以喹诺酮类抗生素消炎、吲哚美辛等对症止痛药物服用，足够疗程用药后刺痛不适症状即可逐渐消失。
同时增加饮水量，有利于帮助症状改善也有利于治疗恢复。刺痛症状没有完全消失前，暂不要有性生活安排，由于性摩擦刺激会影响症状恢复，不利于治疗恢复。