全身发热跟肛周脓肿还是有关系的，因为肛周脓肿是由于肛腺感染，所导致的肛管直肠周围化脓感染性疾病，而感染性的病变就有可能会导致全身发热。
在临床上肛周脓肿按位置的高低，分为高位肛周脓肿和低位肛周脓肿。高位肛周脓肿由于脓腔压力偏高、位置偏深，所以出现发热的概率就比较高，严重的会出现畏寒、寒战，而且高位肛周脓肿受植物神经支配，所以肛门局部的疼痛症状反而不明显。
低位肛周脓肿位置偏低，所以主要症状为疼痛，少部分感染严重的患者也会出现全身发热。