喉咙痛引起头痛，首先考虑是由于感染后病毒入血，对神经系统造成刺激所导致。
发病后应积极地进行抗感染治疗，可口服阿昔洛韦、清开灵颗粒进行对症治疗。有发热的可口服退烧药，头痛严重的可口服非甾体类的抗炎药物，例如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
其次，喉咙痛引起的头痛还有可能是偏头痛发作，本病发病的时候会出现一侧或双侧颈部搏动性的疼痛。病情较轻的可口服非甾体类抗炎药，例如尼美舒利等；疼痛严重的需要服用曲普坦类药物，而且也可以进行头部的按摩来止痛。