通常蓝痣和黑色素瘤，可有以下几方面区别：
第一，两者的发病原因不同。蓝痣的发病原因是患者在胚胎期间，在神经嵴部位的黑素细胞向表皮部位发生逐渐移动，或者是一些原因导致黑素细胞一直停滞在真皮内所形成。而黑色素瘤的发病原因不是很明确，可能与紫外线照射、药物、疾病等因素有关。
第二，两者的临床表现不同。一般蓝痣主要的临床表现为皮肤表面出现蓝色或者黑蓝色的丘疹、小结节，皮损质地比较坚硬，边界比较清楚。黑色素瘤通常表现为原发痣迅速增大，甚至出现形状以及颜色的改变。