回盲瓣综合征最为典型的症状是反复腹泻、右下腹痛、体重减轻等。常见的症状还有食欲减退、腹胀等消化系统紊乱。有右下腹压痛迹象，但无反弹痛和肌肉紧张。
由于回盲瓣脱垂，腹泻和便秘交替发生，右下腹可触及肿块，或有不同程度的直肠出血。轻症患者无需特殊治疗，症状明显的患者均给予对症治疗，肠道菌群紊乱的患者可停用抗生素。
当回盲部皮瓣有严重解剖异常或严重症状，医疗无效，并发肠狭窄、肠梗阻、直肠大出血，或难以与急慢性阑尾炎鉴别时，可考虑手术治疗。