早孕期绒毛隆起的并发症是：可能会造成胎儿发育不良、孕妇出现阴道流血、少数孕妇腹痛。
早期绒毛隆起严重可能会造成胎儿发育不良，其表现为妊娠早期的底蜕膜、绒毛膜向囊内不规则的凸起。研究表明，超声显示有绒毛膜隆起的胎儿患染色体异常的概率相对增加，如果同时合并有其它的高危险因素，发病几率更大。
妊娠早期绒毛膜隆起的发生率极低，妊娠早期合并单发隆起者预后良好。绒毛膜隆起应和早期停育胚胎组织区分开，以免误诊。根据超声影像特征，绒毛隆起也有可能为绒毛积水和基质水肿。