25羟基维生素D3偏低的原因，多是由于体内维生素D3缺乏导致的，常见的疾病主要包括佝偻病、骨软化症、绝经后的骨质疏松、老年性骨质疏松、肾性骨病等。
25羟基维生素D3主要是以肝脏转移的形式存在，是一个中间产物。25羟基维生素D3对疾病的诊断、治疗和监测，都有重要的意义。其它的疾病，包括癌症、心血管疾病、自身免疫系统疾病、糖尿病、抑郁症等，都可能导致这个指标出现偏低或异常。
临床上如果出现25羟基维生素D3偏低，应当适当地加强锻炼，多晒太阳，以利于维生素D的转化，另外也可以给予补充活性维生素D。