侧柏具有凉血止血、化痰止咳、生发乌发的作用。
由于侧柏的性味偏于苦、寒、涩，中医讲苦能泄、寒能清热、涩能收敛，所以侧柏具有清热凉血和收敛止血的作用。临床常用于各种出血症的治疗，尤其适用于热迫血行、血热妄行所导致的出血症。比如像胃热炽盛所导致的吐血，肺热壅盛所导致的咳血，或者是膀胱湿热所导致的尿血，或者大肠湿热导致的便血等症状的治疗。
另外，由于侧柏的性味偏于苦寒，所以也可以用于肺热壅盛，或者是风热犯肺所导致的咳嗽、咳痰、咳痰黏稠色黄、痰吐不利、胸闷等症状的治疗。
此外，侧柏也具有乌发生发的作用，主要用于血热所导致的毛发失于濡养而导致的脱发或者是须发早白等症状的治疗，有凉血祛风的作用。
在具体应用时，如果是用于止血一般炒炭使用，如果用于止咳化痰一般生用。从现代的药理角度来讲，侧柏也具有抗炎、抗菌、祛痰、平喘、止血等功效。