舌扁平苔藓的治疗一般是采用药物治疗，常用的药物包括硫酸羟氯喹和雷公藤多苷片，如果这两类药控制不好，还可以选择使用激素类的药物。
但需要注意雷公藤多苷片的副作用较大，如果有生育需求的患者，是不能够使用的，因为它能够导致患者的生育能力消失。出现了该疾病，需要及早地进行治疗，因为如果治疗不及时或治疗不恰当，还会出现慢性长期的溃疡性改变，甚至还可能发生癌变。
同时，该疾病也不能仅通过药物治疗，患者还要改善平时的生活习惯，避免吃一些会导致口腔黏膜受刺激的食物，平时注意口腔的清洁，以免出现病情的反复。