支原体前列腺炎需要在医师指导下，应用大环内酯类抗生素治疗，常见的药物有罗红霉素、红霉素、阿奇霉素。
支原体前列腺炎在应用这些药物治疗时，建议选择静脉滴注的方法治疗，这样药物可以更好进入到前列腺组织内发挥药效。由于前列腺炎患者会出现前列腺肿胀、疼痛现象，所以还应当搭配一些具有活血化瘀功效的中成药进行治疗。
治疗康复期间，要避免频繁久坐或者憋尿，可以经常按摩小腹部和会阴部。这样可以促进前列腺血液循环，能有效改善前列腺炎引起的小腹隐痛感与尿急症状。