对于肾萎缩的治疗，首先需要明确导致肾萎缩的病因。针对原发疾病进行治疗，才能更有效地控制肾萎缩的速度。
引起肾萎缩的原因比较复杂，比如慢性肾衰竭的终末期、肾动脉狭窄、血栓、先天性肾发育不良。还有一些泌尿系结石、重度积水导致的肾功能丧失，也容易出现肾萎缩。
如果是肾动脉狭窄导致，需要规律口服药物治疗。必要时，需要进行肾动脉支架植入术，使肾动脉狭窄得到扩张，减轻肾萎缩。
针对梗阻患者，需要通过手术解除泌尿系结石以及肾积水。如果是慢性肾衰竭终末期的患者，需要进行及时的肾脏替代治疗。