先天性心脏病的最佳治疗时间，需要根据患儿的先天性心脏病类型而决定，不同的个体间存在差异性。
如果患儿是单纯的先天性心脏病，比如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭等，根据孩子的具体病情以及年龄，定期复查，看是否有自愈可能，先观察和保守治疗到孩子三周岁左右，如果到那时没有改善，再进行手术治疗。
如果患儿是复杂的先天性心脏病，大多数需要在出生后，就立即进行手术，保住性命。但是如果病情特别复杂，一出生就手术风险比较大，可以先维持治疗，等孩子大一点的时候，再手术。