通过肠镜切除直肠绒毛状腺瘤是这种疾病目前首选的治疗方法。但是也存在一定弊端，肠镜手术相较于开腹手术，具有操作简单、出血少、创伤小、易恢复的特点，易于被患者接受，而且术后效果较好。
但由于肠镜下视野暴露不充分、操作空间有局限性，存在肿物不能完整切除的可能，而且由于肠镜只能在肠内进行操作，无法观察到肠壁外侧的情况，容易发生肠穿孔等并发症。
但总体，肠镜手术的实用性，还是较强的。而且对于直肠这种较接近肠管末端的部位，操作更为便捷。绒毛状腺瘤虽然是一种良性肿瘤，但恶变率较高，一旦发现了肿瘤存在，应当立即确诊以后，行相应治疗。