细菌性结膜炎主要局部用消炎的滴眼液和眼膏。滴眼液建议白天滴用，平均一天四到六次，眼膏睡前滴用一次，如果炎症较重，还会考虑口服消炎的药物，比如头孢类，并且频繁滴消炎的滴眼液，可以平均一小时一次。
炎症期间一定要注意个人的用眼卫生，尤其是急性的细菌性结膜炎，是有传染性的，一定不能与他人共用个人物品，比如脸盆、毛巾等，不要去公共场合，避免接触公共物品。
另外，饮食上一定要注意清淡，不要吃辛辣、刺激性的食物。