鳃裂瘘管目前是不建议通过中医的方式来进行治疗，这是由于造成鳃裂瘘管的病因所决定。
因为鳃裂瘘管属于一种先天性的发育异常的疾病，瘘管一旦形成，是无法通过中药、中成药或针灸、推拿等中医治疗疾病的方式来逆转。且目前并没有明确的中医治疗方案是经过有效论证的，针对鳃裂瘘管疾病有显著治疗作用的办法。
因此，目前在临床上，针对鳃裂瘘管的治疗，手术的切除仍然是唯一有效的可以根治疾病的方式。对于鳃裂瘘管反复发生感染的情况，还是建议尽快进行手术治疗。