小儿脑积水需要手术治疗，是小儿脑积水的唯一有效治疗选择，而药物治疗仅作为缓解症状的治疗。
有20%的先天性脑积水患儿在2~5岁期间自然缓解，这种情况脑脊液分泌与吸收趋于平衡，可不需治疗。大多数患儿症状逐渐恶化，会出现神经功能障碍和智力发育低下，需要积极治疗。有些后天性脑积水需要同时进行病因治疗和对症治疗。
脑积水药物治疗效果有限，以手术治疗为主。脑水肿急性期可给予利尿剂和渗透性药物缓解症状，也可反复穿刺腰椎引流脑脊液，对出血性及感染因素导致的急性脑积水也有一定疗效。