氢氯噻嗪常见的副作用就是水、电解质紊乱。
氢氯噻嗪是临床常用的一种利尿剂，除了可以治疗各种原因导致的水肿性疾病外，还可用于尿崩症和高血压等疾病。氢氯噻嗪通过抑制远端小管前端和近端小管对氯化钠的重吸收，促进了水和钠、钾、镁、磷等离子的排泄，容易引起水电解质紊乱。
氢氯噻嗪会抑制胰岛素释放，使得糖耐量降低，血糖升高。除此以外，还会干扰肾小管排泄尿酸，使得尿酸水平增高，甚至诱发痛风。还有少数人会出现过敏反应和白细胞、血小板减少。