因为对于一些无症状感染者或轻症感染者，感染后恢复得很快，可能三到五天咽部核酸就检测不到了。通过一些研究可以发现，一部分新冠感染者粪便或肛拭子核酸阳性持续的时间要比上呼吸道核酸阳性持续的时间更长。因此就增加了肛拭子核酸检测，这样能够提高感染者的检出率，减少漏诊的几率。
但是因为刚肛拭采集不如咽拭方便，因此，目前只对隔离点等重点人群进行采集，并且是同时采集咽拭和肛拭。
新冠肺炎感染者血清抗体持续的时间更长，大部分可以超过半年，因此有必要时还会增加血清抗体的检测。总之都是为了提高检出率，降低假阴性的概率。